토가어에는 자음이 21개 있다. 자음체계를 표로 보이면 아래와 같다.
| 조음위치/조음방법 | 무기파열음 | 유기파열음 | 비음 | 설측음 | 무기파찰음 | 유기파찰음 | 무성마찰음 | 유성마찰음 | 반모음 |
| 양순음 | p | ph | m | | | | | | w |
| 치음 | | | | | ts | tsh | s | z | |
| 전경구개음 | | | ȵ | | tɕ | tɕh | ɕ | | j |
| 치조음 | t | th | (n) | l | | | | | |
| 설근음 | k | kh | ŋ | | | | x | Ɣ | |
추가 설명:
파열음과 파찰음은 무성음만 있고 유성음은 없지만 음운과정에서 흔히 유성음으로 되는 현상이 있다.
l과 n은 자유로 넘나들기(自由变读)되기 때문에 l을 대표음으로 한다.
ȵ은 i과 i로 시작된 복모음 또는 비음화된 운모와 결합한다.
x와 u, x와 u로 시작된 복모음이 결합하면 어느정도 유기음으로 된다.
모음으로만 한 음절을 이룰 경우 앞에 성문파열음(ʔ)이 동반된다.