위구르 표준어는 10-11세기 카라한 칸국 시대에 동서 튀르크어와 타직, 이란 등의 중앙 아시아 원주민들의 상호영향 하에 형성되었다. 튀르크 계통인 우즈벡어나 카자크어 뿐만 아니라 아주 오래된 이란 계열 차용어 또한 차용 어휘의 많은 부분을 차지한다. 14-16세기 무렵에는 이슬람의 종교적 영향과 페르시아 문학의 영향으로 과학이나 종교 영역에서 쓰이는 추상적 개념에 대한 아랍 어휘들이 유입되었다. 현대에는 중국과 러시아의 영향을 받고 있다.