명사의 소유 패러다임 외에는 단어의 어순에 따라 통사적 관계를 표현한다. 알류트어의 어순은 SOV 고정어순이다. 알류트어에서는 화제 중심의 언어로서 술어는 화제와 일치를 보인다. 따라서 주어 외의 화제를 가진 경우 (동사의 제 2활용) 3인칭에서는 소위 anaphoric agreement가 일어난다.

주어가 화제인 경우에는 주어와 직접 목적어의 명사는 절대격

주어가 화제가 아닐 때는 상대격이며, 화제화 된 요소는 문장에 드러나지 않는다.

의문문에서도 알류트어의 SOV 어순은 유지된다. 의문문 어말의 동사 자리에는 constative, 과거시제, 미래시제가 쓰일 수 있다. 현재와 관련된 동사는 가정법으로 쓴다. 의문문 어말의 동사에 비미래시제 -ку-는 쓸 수 없다.