• 에네츠어의 자음은 총 22개이다. 에네츠어는 다수의 음소가 이음(allophone)을 갖는데(1999:10), 이 때 학자에 따라 음소로 인정하는 음의 수에는 차이가 있다. 예를 들어, 반자음 w를 음소로 제시하는지, 구개음화된 t를 독립된 음소로 제시하는지의 여부는 학자들마다 다른 견해를 보인다. 본문에서는 구개음화 된 t는 그 유성음 짝 d와의 형평성을 고려하여 음소로 포함시켰으나, 반자음 w는 소수의 차용어에서만 나타나므로 음소의 개수에서 제외하였다.

• В(w), ӈ(ŋ), х(x)는 그 쓰임세가 제한적이어서, в(w)는 네네츠어와 함께 쓰는 몇몇 단어나 러시아어 차용어에서; ӈ(ŋ)은 소수 단어의 어두 또는 어형변화에; х(x)는 주로 문법적 포먼트에 나타난다. й(j)는 단어 중간이나 어말에서만 나타난다(1966).
• 테레쉔코(1966)는 비음화된 후두음(ʼɦ)과 비음화되지 않은 후두음(ʼʼɧ)을 구분하며 다음과 같은 예를 들었다(1966:439-40).

그러나 2001년에 출간된 소로키나 & 볼리나의 에네츠어 사전에는 위의 단어들이 다음과 같이 등재되어서 후두음의 구분을 반영하고 있지 않다. 본문에서는 좀 더 최근의 연구물의 동향에 따라 후두음을 세분하지 않고 하나로 제시하였다.

(‘자고새나 여우 등의 사냥기구’는 표제어 없음)

두 가지 후두음을 구분하는 테레쉔코의 경우, 명사의 격변화 클래스 역시 두 가지 종류로 세분시켰다(22_noun 항목 참조).

• 장자음이 있으나 학자에 따라 같은 동일한 자음을 장자음으로 기술하는지의 여부가 주관적이며, 이와 관련하여 Терещенко(1993:344)는 에네츠어 자음의 장단이 불안정하다고 평가한다.

비고.

(비고. тонэ(tone) ‘오물(생선)’은 비등재)