무라오어의 자음은 총 31개이다. 무라오어 자음의 특징은 다음과 같다.

• 몇 개의 어기조사 외에 원음으로 시작하는 음절이 없다. 그러므로 후색음 ʔ는 일률적으로 표기하지 않는다.
• c, cʰ, ç는 k kʰ h는 구개음으로 kj kʰj hj으로 쓸 수도 있다.
• 성모 hɣ 는 xɣ으로 많이 읽힌다. 단순성모 h는 hɣ으로 쓴다.
• 성모 w는 경우에 따라 순치마찰음 v로 읽힌다.