동부요고르어에서 의문문을 만드는 방법은 여러가지가 있다.
문말 어조를 올리는 방법, 의문대명사를 사용하는 방법, 의문어기조사를 사용하는 방법, 서술어의 긍정형식과 부정형식을 나란히 놓아서 만드는 방법 등이 있다.
의문 대명사가 출현하는 설명 의문문에서는 의문 대명사를 포함하고 있으므로 일반적으로 어기조사를 사용하지 않는다. 그리고 전체 문장의 강세는 의문 대명사에 놓인다.
긍정형식과 부정형식을 나란히 놓아서 의문문을 만드는 경우, 서술어 앞에 반드시 'ˀaŋ'을 부가하여야 한다.
선택 의문문에서는 접속사를 사용하여 앞 뒤를 연결하는 경우가 많다.
| ˀaŋ | muh | mɔːi | ˀihaːu? | kɔnmuh | ˀo | ˀihaːu? |
| is.isnot | is | 2SG | go | or | 1SG | go |