푸유마어의 음운규칙은 다음과 같다.

• (1)p, t, ʈ, k가 단어 맨 앞이나 단어 중간에 출현할 때, 무기 무성 파열음으로 발음되지만 글자 끝에 올 때는 pʰ,tʰ, ʈʰ, kʰ와 같이 유기음으로 발음된다.

• (2) b, d, ɖ, g는 유성 파열음이나, 단어 맨 뒤에 위치할 때는 무성 파열음 p, t, ʈ, k 로 발음된다

• (3) 마찰음 s 가 고모음 ｉ앞뒤에 오면 연구개음화 되어 ʃ로 발음된다.