토가어에는 자음이 21개 있다. 자음체계를 표로 보이면 아래와 같다.
| 조음위치/조음방법 | 무기파열음 | 유기파열음 | 비음 | 설측음 | 무기파찰음 | 유기파찰음 | 무성마찰음 | 유성마찰음 | 반모음 |
| 양순음 | p | ph | m | w | |||||
| 설첨전음 | ts | tsh | s | z | |||||
| 설면전음 | ȵ | tɕ | tɕh | ɕ | j | ||||
| 설첨중음 | t | th | (n) | l | |||||
| 설근음 | k | kh | ŋ | x | Ɣ |
추가 설명: - 파열음과 파찰음은 무성음만 있고 유성음은 없지만 음운과정에서 흔히 유성음으로 되는 현상이 있다. - l과 n은 자유로 넘나들기(自由变读)되기 때문에 l을 대표음으로 한다. - ȵ은 i과 i로 시작된 복모음 또는 비음화된 운모와 결합한다. - x와 u, x와 u로 시작된 복모음이 결합하면 어느정도 유기음으로 된다. - 모음으로만 한 음절을 이룰 경우 앞에 성문파열음(ʔ)이 동반된다.